⑴ 购进农产品的扣除率
农产品进项税额核定扣除适用的扣除率是销售的产成品的税率，可以是16%，也可以是10%。计算扣除适用于10%，农产品进项税额核定扣除适用以购进农产品为原料生产销售液体乳及乳制品、酒及酒精、植物油的增值税一般纳税人，扣除适用于其他纳税人直接从农业生产者处购进免税农产品的情形。
⑵ 农产品进项税额核定扣除和计算扣除的区别
1、适用范围不同：农产品进项税额核定扣除适用以购进农产品为原料生产销售液体乳及乳制品、酒及酒精、植物油的增值税一般纳税人。计算扣除适用于其他纳税人直接从农业生产者处购进免税农产品的情形。
2、扣除率不同：农产品进项税额核定扣除适用的扣除率是销售的产成品的税率，可以是16%，也可以是10%。计算扣除适用于10%。
(2)农产品核定扣除时扣除率是多少扩展阅读
《农产品增值税进项税额核定扣除试点实施办法》（财税〔2012〕38号发布，以下简称《试点实施办法》）规定的方法，核定出当期可抵扣的进项税额。
购进环节无论取得何种凭证，均以外购金额的价税合计数计入原材料成本。
也就是说，购进农产品取得专票或者海关进口增值税缴款书的，按照价税合计数计入原材料成本；取得销售发票或者收购发票的，按照买价计入原材料成本。
农产品的外购金额均不含买价之外单独支付的运费和入库前的整理费用，这一点与存货会计准则的规定有所不同。
因此，纳税人从凭票扣除体系转换为核定扣除体系的，应自执行核定扣除办法之日起，将期初库存农产品以及库存半成品、产成品耗用的农产品增值税进项税额作转出处理，计入相关存货成本。